- l'exploitation directe, ou régie : la collectivité - commune ou regroupement de communes - assure elle-même l'exploitation des modes de traitement. Délicat à mettre en oeuvre pour la collectivité, ce système est de moins en moins utilisé.

- le marché public d'exploitation : la collectivité confie à une entreprise, le plus souvent privée, la charge de gérer la ou les installation(s) de son ou ses mode(s) de traitement des déchets. Par exemple dans le cas de l'incinération, l'usine est la propriété de la collectivité qui définit à la fois les besoins et les investissements, tandis que l'exploitant a pour seule mission de faire fonctionner l'installation selon le cahier des charges remis par la collectivité ; sa rémunération forfaitaire est déterminée de manière contractuelle.

- la délégation de service public (DSP) : la collectivité confie à une entreprise, le plus souvent privée, la totalité de l'exploitation d'un mode de traitement. A partir du cahier des charges remis par la collectivité, l'exploitant définit l'usine et prend en charge l'ensemble des investissements. Il est rémunéré selon un prix à la tonne traitée fixé à l'avance, mais reste libre de traiter des déchets extérieurs complémentaires.